Program Doktor (S3) Ilmu Pertanian diharapkan dapat menghasilkan lulusan yang mampu menguasai dan mengembangkan pengetahuan, memecahkan permasalahan dan melakukan riset dalam bidang ilmu pertanian.
Kompetensi lulusan Program Doktor (S3) Ilmu pertanian sebagai berikut:
- Ilmuwan dan Peneliti Inovatif yang mampu mengembangkan ilmu dan teknologi pertanian tropis berkelanjutan.
- Pemimpin Profesional dengan keterampilan manajerial berbasis prinsip tata kelola perguruan tinggi yang baik.
- Pengembang Kebijakan Pertanian yang dapat merumuskan kebijakan berbasis riset untuk keberlanjutan dan kesejahteraan masyarakat.
- Inovator Teknologi Pertanian yang menciptakan produk unggulan spesifik lokasi berbasis IPTEK berdaya saing global.
- Fasilitator Pemberdayaan Masyarakat yang mampu menerapkan inovasi teknologi untuk meningkatkan kapasitas petani.
- Wirausahawan Pertanian yang mampu membangun bisnis berbasis sumber daya lokal dengan orientasi pasar global.